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林夏與蘇銘根據陳教授提供的線索，最終確認“幽靈”的真實身份竟然是他本人。原來陳教授因不滿學術界的腐敗現象，加上妻子被境外勢力要挾，才走上了犯罪道路。真相大白后，一場驚心動魄的終極對決在醫院展開。
陳教授約見林夏的地方是一家私立醫院，他向林夏坦白了一切。三年前，他的妻子身患重病，需要巨額醫療費用，境外勢力以此為要挾，迫使他加入了“暗網計劃”。陳教授利用自己在密碼學界的聲望，暗中組建了這個跨國犯罪集團，345iii正是他設計的核心加密系統。
林夏試圖說服陳教授投案自首，但對方已經深陷其中，無法自拔。就在這時，蘇銘帶領特警趕到，將醫院重重包圍。陳教授劫持了一名護士作為人質，要求林夏獨自進入他的辦公室。林夏不顧蘇銘的反對，毅然走進辦公室。
在辦公室內，陳教授向林夏展示了345iii的完整源代碼，這是一個可以破解全球金融系統的超級病毒。他告訴林夏，只要她愿意加入自己，就可以用這項技術改變世界。林夏經過激烈的思想斗爭，決定用情感打動陳教授。她提到陳教授去世的妻子曾說過的話——希望他成為一個光明磊落的人。
陳教授最終放下武器，跪地痛哭。蘇銘沖進辦公室，將陳教授逮捕歸案。一個月后，345iii案正式宣判，陳教授判處無期徒刑，其他成員也受到了法律的嚴懲。林夏站在法院門口，看著天空，露出了久違的笑容。蘇銘走到她身邊，兩人并肩離去，迎接新的生活。
案件結束后，林夏拒絕了多家國際頂級科技公司的邀請，決定留在警局擔任技術顧問，繼續幫助蘇銘破案。兩人在經歷了這場生死考驗后，感情更加深厚。在一個陽光明媚的下午，蘇銘約林夏來到初次相遇的咖啡廳，準備向她表白。
