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蘇晚晴在整理植物園地下溫室時(shí)，意外發(fā)現(xiàn)一組距今三千萬(wàn)年的原始裸子植物化石標(biāo)本，這一發(fā)現(xiàn)足以改寫中國(guó)植物學(xué)史。林野聞?dòng)嵹s來(lái)，兩人冒著塌方危險(xiǎn)深入勘探，卻遭遇神秘人的暗中監(jiān)視。
蘇晚晴帶著科研團(tuán)隊(duì)對(duì)化石群進(jìn)行搶救性挖掘，林野負(fù)責(zé)安全保障工作。挖掘過(guò)程中，一株保存完好的"鎮(zhèn)園之寶"——一棵三米高的銀杏化石驚艷亮相，這正是植物園名字的真正來(lái)源。消息傳出后，綠野集團(tuán)董事長(zhǎng)周建國(guó)親自到訪，提出高價(jià)收購(gòu)化石用于商業(yè)展覽，遭到蘇晚晴拒絕。
當(dāng)晚，植物園遭遇不明身份人員潛入，林野在追捕過(guò)程中受傷。蘇晚晴意識(shí)到事情遠(yuǎn)比想象中復(fù)雜，她決定將化石轉(zhuǎn)移至國(guó)家博物館妥善保管。與此同時(shí)，她收到一封匿名信，信中暗示父親十年前的死因與這場(chǎng)化石發(fā)現(xiàn)有關(guān)。
蘇晚晴與林野的默契在危難中進(jìn)一步加深，林野不顧傷痛堅(jiān)持守護(hù)植物園。蘇晚晴開始調(diào)查父親去世的真相，而林野的前導(dǎo)師陳教授突然聯(lián)系林野，透露了一個(gè)關(guān)于植物園地下藏著更大秘密的消息。
